同一张增值税发票认证了两次该如何处理呢?

答：在远程认证系统中，如果出现重复认证的情况，在“专用发票认证结果清单”的“认证结果”上会出现“重复认证”的提示，并且在“认证结果通知书”上只显示正常的可以抵扣的发票税额。

增值税发票进项票重复认证了，请到主管税务局查询信息，一般只取第一次的信息(主管税务局一般也只有一个发票认证信息)。

根据国家税务总局关于修订增值税专用发票使用规定的通知

国税发[2006]156号

第二十七条 经认证，有下列情形之一的，暂不得作为增值税进项税额的抵扣凭证，税务机关扣留原件，查明原因，分别情况进行处理。

(一)重复认证。

本规定所称重复认证，是指已经认证相符的同一张专用发票再次认证。

(二)密文有误。

本规定所称密文有误，是指专用发票所列密文无法解译。

(三)认证不符。

本规定所称认证不符，是指纳税人识别号有误，或者专用发票所列密文解译后与明文不一致。

值得一提的是，认证不等同于抵扣，填写进纳税申报表了才是正式的申报抵扣。